Alergene glede na njihov vstop v telo razvrščamo v štiri velike skupine. V prvi so alergeni, ki jih vdihavamo (predvsem pelodi vetrocvetk, ki cvetijo od februarja do pozne jeseni). V drugi skupini so alergeni, ki jih zaužijemo (hrana živalskega in rastlinskega izvora, nekatera zdravila). V tretji so kontaktni alergeni, ki reakcijo sprožijo ob stiku s kožo (npr. kemikalije, zdravila, rastline, encimi), v četrti pa so parenteralni alergeni, ki pridejo neposredno v krvni obtok (s piki žuželk, injekcijami, infuzijo).